全光谱流式细胞仪的调试和校准： 在使用前，甚至在使用过程中都要精心进行调试，以保证工作的可靠性和佳性。调试的项目主要是激光强度、液流速度和测量区的光路等。
激光强度:除调整反射镜的角度以调整到所需波长的激光出光外，还要结合显示屏上的光谱曲线使激光的强度输出为大。
液流速度:可通过操作台数字显示监督，调节 气体压力大小以获得稳定的液流速度。
测量区光路调节 :这是调试工作的关键。需要保证在测量区的液流、激光束、90散射测量光电系统垂直正交，而且交点较小。一般可在用标准荧光微球等校准中完成。
流式细胞术中所测得的量是相对值，因此需要在使用前或使用中对系统进行校准或标定，这样才能通过相对测量获得的意义。
因而FCM中的校准具有双重功能:仪器的准直调整和定量标度。标准样品应该稳定，有形成份形状应是大小比较一致球形，样品分散性能良好，且经济、容易获得。
全光谱流式细胞仪仪器的操作和使用流程：
1、 打开电源，对系统进行预热；
2、 打开气体阈，调节 压力，获得适宜的液流速度；开启光源冷却系统；
3、 在样品管中加入去离子水，冲洗液流的喷嘴系统；
4、 利用校准标准样品，调整仪器，使在激光功率、光电倍增管电压、放大器电路增益调定的基础上，0和90散射的荧光强度强，并要求变异系数为小；
5、 选定流速、测量细胞数、测量参数等，在同样的工作条件下测量样品和对照样品;同时选择计算机屏上数据的显示方式，从而能直观掌握测量进程；
6、 样品测量完毕后，再用去离子水冲洗液流系统；
7、 因为实验数据已存入计算机硬盘(有的机器还备有光盘系统，存贮量更大)，因此可关闭气体、测量装置，而单独使用计算机进行数据处理；
8、将所需结果打印出来。
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